为了保持雨花石的美观特性并防止其变质，需要采取适当的储存方法。

一是防酸、防碱。雨花石的主要化学成分是二氧化硅，基本呈中性。它在自然界所处的地质环境中也基本呈中性。因此，存储环境也必须保持中性。如果太酸或太碱，酸、碱中的离子就会与石材中的色素离子发生化学反应，导致石材变质、腐蚀或变色。一般情况下水是中性的，无论是酸性还是碱性的水都会对雨花石产生影响。展览期间，最好使用蒸馏水或煮沸的冷却水。如果可能的话，在使用水之前，可以使用pH试纸测试水的pH值。如果pH值大于7，则呈碱性，如果pH值小于7，则呈酸性。如果太碱，加一点食用白醋；如果太酸，加一点食用碱，调节PH值到7。

二是防止受热、暴晒。加热或暴露在强光下也会随着温度升高而改变色素离子的性质，导致雨花石变质。储存时应远离热源，避免阳光照射。

三是防止干燥、开裂。雨花石在自然环境中必须保持一定的湿度。有些雨花石含有水分子。如果长时间保持干燥，就会失去自由水分子，表面可能会开裂。特别是抛光的宝石和蛋白石如果长时间干燥就会破裂。储存期间，最好保持相对湿度。还要防止机械碰撞，在外力作用下会产生裂纹、断裂，搬运时要小心。